As pesquisas em andamento contam com o apoio de laboratórios setoriais (veja abaixo), além do Laboratório de Taxidermia, do Laboratório de Radiografia & Processamento de Imagens Computadorizadas e do Laboratório de Pesquisa em Biodiversidade Molecular de Vertebrados.

O acervo e a estrutura organizacional do Departamento de Vertebrados compreendem quatro setores, a saber: Herpetologia (“répteis” e anfíbios), Ictiologia (“peixes”), Mastozoologia (mamíferos) e Ornitologia (aves).